Mikrobiom Przewodu Pokarmowego Człowieka – Wybrane Dane

Mikrobiom Przewodu Pokarmowego Człowieka – Wybrane Dane

Advancements of Microbiology

Volume 61 (2022): Issue 4 (December 2022)

By:

Beata Tokarz-Deptuła, Paulina Dudziak, Natalia Gurgacz and Wiesław Deptuła

Open Access

|Nov 2022

Figures & Tables

Bakterie, archeony i grzyby reprezentujące różne grupy systematyczne występujące w żołądku

	Populacje mikroorganizmów	Piśmiennictwo
Bakterie	Gromada: Firmicutes, Bacteroidota, Proteobacteria, Actinobacteria, Fusobacteria.Rodzina: Enterobacteriaceae.Rodzaj: Lactobacillus, Streptococcus, Staphylococcus, Bacteroides, Veillonella, Corynebacterium, Clostridium, Neisseria, Stomatococcus, Prevotella, Rothia, Haemophilus, Atopobium, Porphyromonas, Gamella, Helicobacter, Propionibacterium, Fusobacterium, Achromobacter, Rhodococcus, Micrococcus, Bacillus, Actinobacillus.Gatunek: Helicobacter pylori, Campylobacter pyloridis, Fusobacterium nucleatum, Lactobacillus (L.) lactis, L. brevis, L. johnsonii.	[17, 45, 71, 84, 87, 94, 119, 120]
Archeony	Gatunek: Methanobrevibacter smithii.	[43]
Wirusy	Brak danych.
Grzyby	Gromada: Ascomycota, Basidiomycota,Klasa: Saccharomycetes, Dothideomycetes, Eurotiomycetes, Agaricomycetes, Tremellomycetes.Rodzina: Aspergillaceae, Chaetomiaceale, Pleosporaceae, Trimorphomycetaceae.Rodzaj: Candida, Phialemonium, Alternaria, Thermomyces, Saitozyma.Gatunek: Candida albicans, Aspergillus montevidensis, Penicillium arenicola.	[45, 119, 120]

Bakterie, archeony, wirusy i grzyby, reprezentujące różne grupy systematyczne występujące w jamie ustnej

	Populacje mikroorganizmów	Piśmiennictwo
Bakterie	Gromada: Firmicutes (obecnie Bacillota), Fusobacteria, Proteobacteria, Actinobacteria, Bacteroidota, Chlamydiae, Chloroflexi, Spirochaetes, Synergistetes, Saccharibacteria, Gracilibacteria.Rodzina: Staphylococcaceae, Propionibacteriaceae, Burkholderiaceae, Neisseriaceae, Fusobacteriaceae.Gatunek: Streptococcus (S) sanguinis, S. mutans, S. oralis, Veillonella sp., Granulicatella sp., Gamella sp., Actinomyces sp., Corynebacterium sp., Fusobacterium sp., Porphyromonas sp., Prevotella sp., Capnocytophaga sp., Haemophilus sp., Treponema sp., Lactobacterium sp., Eikenella sp., Leptotrichia sp., Peptostreptococcus sp., Staphylococcus sp., Eubacteria sp., Pseudoramibacter sp., Propionibacterium sp., Moraxella sp., Campylobacter sp., Desulfobacter sp., Desulfovibrio sp., Fusobacterium sp., Selemonas sp., Simonsiella sp., Wolinella sp., Neisseria perflava, Rothia mucilaginosa.	[14, 23, 38, 46, 53, 72, 84, 86, 92, 117]
Archeony	Rząd: Thermoplasmatales.Gatunek: Methanobrevibacter (Mbb.) sp., w tym: Mbb. oralis, Mbb. smithii, Methanobacterium sp., Methanosarcina sp., Methanosphaera sp., Candidatus Nitrososphaera evargladensis, Methanomassilicoccus luminyensis.	[8, 26, 49, 118]
Wirusy	Rząd: Caudovirales.Rodzina: Herpesviridae, Papillomaviridae, Anelloviridae, Siphoviridae, Myoviridae.Gatunek: bakteriofagi dla bakterii z rodzaju Streptococcus, Veillonella, Escherichia, Bulkholderia, Salmonella, Megasphaer, Roseolovirus oraz wirusy: Human cytomegalovirus, Herpes simplex virus, Coxsackievirus A5, Enterovirus A, wirus Epstein-Barr.	[45, 47, 74, 88, 92, 118]
Grzyby	Rząd: Saccharomycetales.Rodzaj: Candida, Cladosporium, Aureobasidium, Aspergillus, Fusarium, Cryptococcus, Alternaria, Malassezia.Gatunek: Candida albicans.	[1, 6, 14, 23, 45, 80, 118]

Bakterie, archeony, wirusy i grzyby reprezentujące różne grupy systematyczne występujące w jelicie grubym

	Populacje mikroorganizmów	Piśmiennictwo
Bakterie	Gromada: Bacteroidota, Fiumicutes, Actinobacteria, Proteobacteria, Verrucomicrobia.Rodzina: Enterobacteriaceae, Bacteroidaceae, Prevotellaceae, Rikenellaceae, Lachnospiraceae, Ruminococcaceae.Rodzaj: Bacteroides, Enterococcus, Eubacterium, Clostridium, Peptostreptococcus, Streptococcus, Bifidobacterium, Fusobacterium, Lactobacillus, Prevotella, Ruminococcus, Akkermansia, Roseburia, Butyrivibrio, Lachnospira, Faecalibacterium.	[1, 17, 45, 46, 91, 94, 103]
Archeony	Gromada: Crenarchaeota, Traumarcheota.Gatunek: Methanobrevibacter (M.) smithii. M. stadtmanae, M. luminyensis, Halorubrum (H.) koreense, H. alimentarium, H. saccharovorum, Halococcus morrhuae, Halopherax massiliense, Methanomassiliicoccales sp., Nitrosphaera sp., Sulfobolus sp.	[26, 76, 94, 113]
Wirusy	Rząd: Caudovirales.Rodzina: Podoviridae, Picornaviridae, Picobirnaviridae, Astroviridae, Reoviridae, Caliciviridae, Adenoviridae, Anelloviridae, Cycloviridae, Parvoviridae, Retroviridae, Pneumoviridae, Herpesviridae, Hepadnaviridae i Microviridae.Rodzaj: Enterovirus, Rotavirus, Norovirus, Papillomavirus, Polyomavirus, Mimivirus, Marseillevirus.Gatunek: bakteriofagi bakterii rodzaju Bacteroides, Firmicutes i Actinobacteria.	[17, 19, 45, 76, 85, 108, 115]
Grzyby	Gromada: Ascomycota, Basidiomycota, Mucoromycota.Rodzina: Cystofilobasidiaceae.Rodzaj: Saccharomyces, Malassezia, Candida, Penicillium, Cladosporium, Galactomyces, Cryptococcus, Aspergillus, Pichia, Mucor, Eurotium, Rhodotorula, Trichosporon.Gatunek: Beauveria bassiana, Lichtheimia ramosa, Clavispora lusitaniae, Galactomyces geotrichum, Isaria farinosa, Pleurostomophora richardsiae, Rhodosporidium kratochvilovae, Torulaspora delbrueckii, Yarrowia lipolytica, Aspergillus clavatus, Alternalia brassicola, Saccharomyces cerevisiae, Geotrichum sp., Cystofilobasidium sp.	[16, 17, 45, 52, 76, 80, 109]

Enterotypy jelita grubego [20, 51, 87]

	Dominujące rodzaje bakterii	Dieta
Enterotyp 1	Bacteroides	Dieta typu bogata w tłuszcze zwierzęce i białko
Enterotyp 2	Prevotella	Dieta wysokobłonnikowa (roślinna)
Enterotyp 3	Ruminococcus	Dieta bogata w skrobię

Bakterie, wirusy i grzyby reprezentujące różne grupy systematyczne występujące w gardle

	Populacje mikroorganizmów	Piśmiennictwo
Bakterie	Gromada: Bacteroidota, Proteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria i Fusobacteria.Rodzaj: Staphylococcus. Prevotella, Capnocytophaga, Campylobacter, Veillonella, Streptococcus, Neisseria oraz Haemophilus.Gatunek: Streptococcus viridans, Branhamella catarrhalis, Neisseria sp., Haemophilus sp.	[35, 38, 72]
Archeony	Brak danych.
Wirusy	Gatunek: Koronawirusy, adenowirusy, pikornawirusy, wirus RSV, wirus grypy A, bakteriofagi.	[31]
Grzyby	Rodzaj: Candida.	[34]

Bakterie, archeony, grzyby i wirusy reprezentujące różne grupy systematyczne występujące w przełyku

	Populacje mikroorganizmów	Piśmiennictwo
Bakterie	Gromada: Firmicutes, Bacteroidota, Actinobacteria, Proteobacteria, Fusobacteria.Rodzaj: Streptococcus, Veillonella, Prevotella, Haemophilus, Neisseria, Granulicatella i Fusobacterium.Gatunek: Streptococcus viridans, Streptococcus faecalis, Haemophilus influenzae, Neisseria catarrhalis, Klebsiella pneumonia.	[27, 45, 69, 77, 89]
Archeony	Rodzaj: Halobacteria, Methanosarcina.	[27]
Wirusy	Rodzina: Herpesviridae (Betaherpesvirus, Gammaherpesvirus), Papillomaviridae, Gammapapillomavirus).Gatunek: bakteriofagi rodzaju Streptococcus, Campylobacter, Lactococcus i γ-Proteobacterii.	[27]
Grzyby	Gatunek: Candida (C.) albicans, C. glabrata, Saccharomyces cerevisiae.	[27]

Bakterie, wirusy i grzyby reprezentujące różne grupy systematyczne występujące w jelicie cienkim

	Populacje mikroorganizmów	Piśmiennictwo
Bakterie	Gromada: Firmicutes, Proteobacteria, Verrucomicrobia, Bacterioidota, Actinobacteria.Rodzina: Enterobacteriaceae, Lactobacillaceae.Rodzaj: Fusobacterium, Enterococcus, Klebsiella, Bacteroides, Ruminococcus, Streptococcus, Lactobacillus, Staphylococcus, Bifidobacterium, Veillonella, Porphyromonas, Prevotella, Clostridium, Corynebacterium, Providencia, Pseudomonas, Actinomyces, Atopobium, Gemella, Granulicatella, Haemophilus, Leptotrichia, Megasphaera, Neisseria, Porphyromonas, Paraprevotellaceae, Escherichia, Rothia, Citrobacter, Lachnoclostridium, Actinobacillus, Parascardovia, Oribacterium, Granulicatella, Campylobacter, Ralstonia.Gatunek: Escherichia coli, Neisseria cinerea, Prevotella (P.) melaninogenica, P. jejuni, P. veroralis, P. aurantiaca, Haemophilus parahaemolyticus, Porphyromonas pasteri, Porphyromonas endodontalis, Fusobacterium nucleatum, Moglibacterium neglectum, Alloprevotella tannerae, Filifactor alocis, Morococcus cerebrosus, Veillonella montpellierensis, Streptobacillus hongkongensis, Clostridium leptum.	[11, 17, 21, 45, 57, 64, 75, 94, 99, 101, 105, 106, 107]
Archeony	Brak danych.
Wirusy	Rodzaj: Rotavirus, Calicivirus, Coronavirus, Adenovirus.	[9]
Grzyby	Rodzaj: Candida, Saccharomyces.	[45]

DOI: https://doi.org/10.2478/am-2022-023 | Journal eISSN: 2545-3149 | Journal ISSN: 0079-4252

Journal RSS Feed

Language: English, Polish

Page range: 223 - 233

Submitted on: Oct 1, 2022

Accepted on: Nov 1, 2022

Published on: Nov 30, 2022

Published by: Polish Society of Microbiologists

In partnership with: Paradigm Publishing Services

Publication frequency: 4 times per year

Keywords:

archea,

grzyby,

Related subjects:

Microbiology and virology

© 2022 Beata Tokarz-Deptuła, Paulina Dudziak, Natalia Gurgacz, Wiesław Deptuła, published by Polish Society of Microbiologists
This work is licensed under the Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 License.

Previous article Volume 61 (2022): Issue 4 (December 2022)Next article