The Association between DNA Methylation Status and Epstein-Barr Virus Infection in Laryngeal Carcinomas

Forward:5′-ACACAACTGTGTTCACTAGC-3′

Reverse:5′-CAACTTCATCCACGTTCACC-3′

PCR

95°C/10 min

40 cycles: 95°C/30 s, 55°C/50 s,

72°C/1 min,

72°C/7 min

Forward:5′-AAATTTAAGAGATCCTCGTGTAAAACATC-3′

Reverse:5′-CGCCTCCTGTTGAAGCAGAT-3′

Probe:5′-(6-FAM)-ATAATGGAGTCAACATCCAGGCTTGGGC-(TAMRA)-3′

qPCR

50ºC/2 min, 95ºC/10 min

40 cycles: 95ºC/15 s, 60ºC/1 min

Forward:5′-CAGTCAGGCAAGCCTATGA-3′

Reverse:5′-CTGGTTCCGGTGGAGATGA-3′

Probe:5′-(6-FAM)-GTCATAGTAGCTTAGCTGAAC-(TAMRA)-3′

qPCR

50ºC/2 min, 95ºC/10 min

40 cycles: 95ºC/15 s, 60ºC/1 min

Forward:5′-CCATCTTCCAGGAGCGAGATCCCT-3′

Reverse: 5′-TGAGCCCCAGCCTTCTTCATGGT-3′

qPCR

96ºC/3 min

40 cycles: 95ºC/10 s, 55ºC/30 s

M-Forward:5′-TTTTAAAAGCGATTTTAAAGGGTC-3′

M-Reverse:5′-TTCGAAAAACTCTAAAAACCCG-3′

U-Forward:5′-TTTAAAAGTGATTTTAAAGGGTTGG-3′

U-Reverse:5′-CACTTCAAAAAACTCTAAAAACCCA-3′

qMS-PCR

50ºC/2 min, 95ºC/10 min

40 cycles: 95ºC/15 s, 58ºC/60 s

50ºC/2 min, 95ºC/10 min

M-Forward:5′-CGAGTTAAGGTTAGCGTTTGTTATC-3′

M-Reverse:5′-AAAATCCCTAATCAAAAAAAACATA-3′

U-Forward:5′-TTGAGTTAAGGTTAGTGTTTGTTATTG-3′

U-Reverse:5′-TAATAACTCCTATTCCTCCTCCAAC-3′

M-Forward:5′-GGATAGTCGGATCGAGTTAACGTC-3′

M-Reverse:5′-CCCTCCCAACGCCGA-3′

U-Forward:5′-GGAGGATAGTTGGATTGAGTTAATGTT-3′

U-Reverse:5′-CAAATCCCTCCCAAACACCAA-3′

Forward:5′-GCGGTATACCCACCATGACA-3′

Reverse:5′-AGGCTTTGCCGGCTTCC-3′

qPCR

96ºC/10 min

40 cycles: 95ºC/10 s, 55ºC/30 s

Forward:5′-CCAACAACACGCAACCAGTG-3′

Reverse:5′-CGTCTTCGAGTCTTGTTCTCGTA-3′