Ryc. 1
Ryc. 2
Ryc. 3
Funkcje filtrów wchodzących w skład modułu odwrotnej wakcynologii programu PanRV [45]
| Lp. | Kryterium działania filtra | Opis |
|---|---|---|
| 1. | Lokalizacja białka | Selekcja białek związanych z błoną, peryplazmatycznych oraz ulegających sekrecji |
| 2. | Niezbędność białka | Selekcja białek kluczowych dla utrzymania żywotności bakterii na podstawie bazy DEG [32] |
| 3. | Rola w wirulencji | Selekcja białek zaangażowanych w procesy infekcji i patogenezy na podstawie baz VFdb oraz MvirDB [30, 76] |
| 4. | Homologia do białek gospodarza i nie patogennych bakterii mikrobioty jelitowej | Selekcja białek nie wykazujących homologii do żadnych białek występujących naturalnie u człowieka lub jego mikrobioty w celu uniknięcia reakcji autoimmunologicznej po zaszczepieniu |
| 5. | Domeny transbłonowe białka | Selekcja białek posiadających mniej niż dwie domeny transbłonowe ze względu na trudność oczyszczania białka |
| 6. | Masa molekularna białka | Selekcja białek o masie poniżej 110 kDa ze względu na łatwość ich oczyszczania i manipulacji w trakcie konstruowania szczepionki |
| 7. | Obecność epitopów | Przewidywanie wiązania do receptorów limfocytów B oraz do zespołów białek MHC I oraz MHC II |